Aby wykonać operację na części obrazka np rozjaśnienie, pozostawiając bez zmian resztę pikseli należy użyć jednego z narzędzi zaznaczania.
Zaznaczenie prostokątne
Klikamy i rysujemy prostokąt, aby zaznaczyć kwadrat o równych bokach wciskamy przycisk CTRL
Zaznaczenie eliptyczne
Klikamy i rysujemy elipsę, aby narysować koło wciskamy przycisk CTRL
Zaznaczenie wieloboczne
Aby narysować jakiś kształt klikamy i puszczamy prawy przycisk myszy, punkty w których klikamy zostaną połączone prostymi, aby zamknąć kształt klikamy w pierwszy postawiony punkt.
Lasso
Z wciśniętym klawiszem myszy możemy obrysować dowolny kształt, w momencie puszczenia klawisza pierwszy i ostatni punkt się połączą.
Magiczna różdżka
Klikając zaznaczamy obszar o tej samej barwie. Magiczna różdżka ma 1 piksel tolerancji co oznacza, że zaznacza tylko piksele o tym samym kolorze.
Usuwanie zaznaczenia
Jeżeli mamy już zaznaczony obszar i chcemy go usunąć wybieramy opcję "Zaznaczenie" > "Usuń". Piksele znikają, pojawia się kolor tła obrazka.
Zmiana koloru tła
Jeżeli chcemy zmienić kolor tła z białego na inny w okienku "Kolory" zmieniamy kolor kwadratu. Kolor wybieramy przez suwaki R,G,B, możemy też sami wpisać ich wartości.
Wypełnianie zaznaczenia
Stwórz zaznaczenie i wybierz opcję "Zaznaczenie" > "Wypełnij" lub wciśnij klawisz Ctrl+F. Zaznaczony obszar zostanie wypełniony pierwszoplanowym kolorem.
Domyślnie nowe zaznaczenie powoduje skasowanie dotychczasowego zaznaczenia.
Tryb dodania zaznaczenia
Wybieramy ten tryb, gdy chcemy dodać nowy obszar do aktualnego zaznaczenia (przykład 1)
Tryb odjęcia od zaznaczenia
Wybieramy ten tryb, gdy chcemy odjąć pewien obszar do aktualnego zaznaczenia (przykład 2).
Tryb przecięcia zaznaczenia
Stosujemy ten tryb, gdy z dwóch obszarów chcemy zaznaczyć tylko część wspólną dla nich obu (przykład 3).
Odwracanie zaznaczenia
Aby dokonać zaznaczenia wszystkich pikseli nie znajdujących się w zaznaczonym obszarze wybieramy opcję: "Zaznaczenie" > "Odwróć zaznaczenie"
Powielenie zaznaczenia
Gdy chcemy skopiować piksele w zaznaczonym obszarze wybieramy "Zaznaczenie" > "Powiel piksele".
Kopiowanie zaznaczenia na oddzielną warstwę
Zaznaczamy obszar który chcemy skopiować wybieramy "Edycja" >"Kopiuj" i "Edycja" > "Wklej". Używając "Wskaźnika" (biała strzałka) przesuwamy obiekt na odpowiednią pozycję.

Wskaźnik
Przesuwanie zaznaczenia
Wybieramy "Zaznaczenie prostokątne", klikamy na brzeg ścieżki i przesuwamy zaznaczenie w nowe miejsce.
Przenoszenie obszaru zaznaczonego
Tworzymy zaznaczenie wokół obiektu, który chcemy przenieść, np.: "Zaznaczenie prostokątne", następnie trzymając wciśnięty klawisz Ctrl możemy przenosić zaznaczenie. W miejscu gdzie było zaznaczenie pojawi się tło.
Krok 1 (wstępne zaznaczenie)
Najpierw obrysuj wstępnie kształt.
Krok 2 (dodawanie obszaru)
Aby usunąć niepotrzebne części w zaznaczeniu użyj trybu odjęcia od zaznaczenia.
Krok 3 (usuwanie obszaru)
Powtarzaj kroki 2 i 3 aż otrzymasz idealne zaznaczenie obiektu.
Końcowe zaznaczenie